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[Source: bowtie2]

Package: bowtie2 (2.5.4-2.6)

Schneller und speichereffizienter Short-Read-Aligner

Bowtie 2 ist ein ultraschnelles und speichereffizientes Werkzeug zum Alignieren von Sequenzierungs- Reads an lange Referenzsequenzen. Es eignet sich besonders gut zum Alignieren von Reads von etwa 50 bis zu Hunderten oder Tausenden von Zeichen und besonders gut zum Alignieren an relativ lange (z. B. Säugetier-) Genome. Bowtie 2 indiziert das Genom mit einem FM Index, um den Speicherbedarf gering zu halten: für das menschliche Genom liegt der Speicherbedarf typischerweise bei etwa 3.2 GB. Bowtie 2 unterstützt gapped-, lokale und Paired-End-Alignment-Modi.

Other Packages Related to bowtie2:

  • dep: /usr/bin/perl

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  • dep: libgcc_s.so.1(GCC_3.3.1)(64bit)

    Package not available

  • dep: libm.so.6()(64bit)

    Package not available

  • dep: libm.so.6(GLIBC_2.2.5)(64bit)

    Package not available

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    Package not available

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    Package not available

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    Package not available

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  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.30)(64bit)

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  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.9)(64bit)

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  • dep: libz.so.1()(64bit)

    Package not available

  • dep: libz.so.1(ZLIB_1.2.0.2)(64bit)

    Package not available

  • dep: libz.so.1(ZLIB_1.2.3.3)(64bit)

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  • dep: libz.so.1(ZLIB_1.2.3.5)(64bit)

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  • dep: libc.so.6(GLIBC_2.38)(64bit)

    Package not available

Download bowtie2

ArchitecturePackage sizeInstalled sizeFilesPackage
x86_641.2 MiB4.2 MiBlist of filesDownload

Paketdateipfade (18)

Paths come from the repository package-file index for the observed builds. They describe archive/package associations, not every file that will exist on a running system after maintainer scripts, alternatives, generated state, diversions, or installation choices.

  • /usr/bin/bowtie2
  • /usr/bin/bowtie2-align-l
  • /usr/bin/bowtie2-align-s
  • /usr/bin/bowtie2-build
  • /usr/bin/bowtie2-build-l
  • /usr/bin/bowtie2-build-s
  • /usr/bin/bowtie2-inspect
  • /usr/bin/bowtie2-inspect-l
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  • /usr/share/doc/packages/bowtie2
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/AUTHORS
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/BOWTIE2_VERSION
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/MANUAL
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/NEWS
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/README.md
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/TUTORIAL
  • /usr/share/licenses/bowtie2
  • /usr/share/licenses/bowtie2/LICENSE

Field source: openSUSE Tumbleweed OSS

Dieses Paket verwenden

OpenFactory kann dieses Betriebssystem in einer Browser-VM starten oder einen Image-Build mit dem nativen Paketnamen aus diesem Datensatz beginnen.

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Versionen, Suiten und Repositories

Jede Zeile ist Paketindex-Metadaten für eine Version, Architektur, Suite und ein Repository. Namen, URLs und Größen stammen aus der Quelle; ein Link ist ein veränderbarer Abrufort, kein Weitergabanspruch von OpenFactory.

VersionReleaseArchitectureRepositoryPackage sizeInstalled sizePublisher repository artifact
2.5.4-2.6tumbleweed / ossx86_64openSUSE Tumbleweed · OSS · multi-architecture1.2 MiB4.2 MiBx86_64/bowtie2-2.5.4-2.6.x86_64.rpm

Field source: openSUSE Tumbleweed OSS

Bekannte Sicherheitslücken

Keine passenden Meldungen in den erfassten Quellen.

Zuletzt synchronisiert:

[CVE-Katalog]

Prüfsummen

Repository signatures authenticate metadata. Artifact hashing is recorded separately. Neither establishes package safety.

2.5.4-2.6 / x86_64Beobachtet Sep 1, 2026sha512 edd2a4c4faed…00b9316ePrüfsumme der Quelle

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Prüfsumme der Quelle (sha512): edd2a4c4faedb97fe7bc17417857e6c3f188f53f4c88aae98feff0f0c5978dba0b542dad54b2a29e53a3d2d4e3b9ffe25951048820c812abd9fb6b6500b9316e

Field source: openSUSE Tumbleweed OSS

Quellen

  • openSUSE Tumbleweed OSSSep 1, 2026

    Authoritative source; repository metadata signature verified

    Signaturnachweis

    tumbleweed-oss-multiarch:4db10cdde3ad82c7e22be35753c9e164b4bdd30f92db4aee17a0d4c94c5f902f

    Repository-signature verification record
    Signed-object SHA-256
    4db10cdde3ad82c7e22be35753c9e164b4bdd30f92db4aee17a0d4c94c5f902f
    Signer fingerprint
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    Keyring revision
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    Tool and policy
    gpgv (GnuPG) 2.4.9
    openfactory-software-catalog-signature-v1
    Verification time
    Sep 1, 2026
    Repository metadata hash linkage
    Result
    Recorded as verified; digest details unavailable