Linux workstation

openSUSE Tumbleweed native package

htsfile

Identifier les fichiers de données de séquençage haut débit du projet HTSlib

Packages / openSUSE Tumbleweed / Productivity/Scientific/Other / htsfile

[Source: libhts]

Package: htsfile (1.21-1.5)

[Project overview: htslib]

External Resources:

Homepage: [github.com]

Similar packages:

  • [bgzip]

    Utilitaire de compression/décompression par blocs du projet HTSlib

  • [libhts3]

    Bibliothèque C pour les formats de données de séquençage à haut débit

  • [libhts-devel]

    Fichiers d'en-tête et bibliothèques pour compiler contre libhts

  • [tabix]

    Indexeur générique pour les fichiers de position génomique délimités par TAB du projet HTSlib

Identifier les fichiers de données de séquençage haut débit du projet HTSlib

HTSlib est une implémentation d'une bibliothèque C unifiée pour accéder aux formats de fichiers courants, tels que SAM, CRAM et VCF, utilisés pour les données de séquençage haut débit, et constitue la bibliothèque centrale utilisée par samtools et bcftools. HTSlib implémente un index BAM généralisé, avec l'extension de fichier .csi (coordinate-sorted index). Le lecteur de fichiers HTSlib cherche d'abord le nouvel index, puis l'ancien si le nouvel index est absent. Ce projet inclut également le populaire indexeur tabix, qui indexe les formats .tbi et .csi, ainsi que l'utilitaire de compression bgzip.

Other Packages Related to htsfile:

  • dep: libbz2.so.1()(64bit)

    Package not available

  • dep: libcrypto.so.3()(64bit)

    Package not available

  • dep: libcrypto.so.3(OPENSSL_3.0.0)(64bit)

    Package not available

  • dep: libcurl.so.4()(64bit)

    Package not available

  • dep: [libhts3] (= 1.21)

    Bibliothèque C pour les formats de données de séquençage à haut débit

  • dep: libhtscodecs.so.2()(64bit)

    Package not available

  • dep: liblzma.so.5()(64bit)

    Package not available

  • dep: liblzma.so.5(XZ_5.0)(64bit)

    Package not available

  • dep: libm.so.6()(64bit)

    Package not available

  • dep: libm.so.6(GLIBC_2.2.5)(64bit)

    Package not available

  • dep: libm.so.6(GLIBC_2.29)(64bit)

    Package not available

  • dep: libz.so.1()(64bit)

    Package not available

  • dep: libc.so.6(GLIBC_2.38)(64bit)

    Package not available

Download htsfile

ArchitecturePackage SizeInstalled SizeFiles
x86_64449 KiB1.2 MiB[list of files]

Chemins de fichiers du paquet (13)

Paths come from the repository package-file index for the observed builds. They describe archive/package associations, not every file that will exist on a running system after maintainer scripts, alternatives, generated state, diversions, or installation choices.

  • /usr/bin/annot-tsv
  • /usr/bin/htsfile
  • /usr/share/doc/packages/htsfile
  • /usr/share/doc/packages/htsfile/NEWS
  • /usr/share/doc/packages/htsfile/README
  • /usr/share/licenses/htsfile
  • /usr/share/licenses/htsfile/LICENSE
  • /usr/share/man/man1/annot-tsv.1.gz
  • /usr/share/man/man1/htsfile.1.gz
  • /usr/share/man/man5/faidx.5.gz
  • /usr/share/man/man5/sam.5.gz
  • /usr/share/man/man5/vcf.5.gz
  • /usr/share/man/man7/htslib-s3-plugin.7.gz

Field source: openSUSE Tumbleweed OSS revision tumbleweed-oss-multiarch:4db10cdde3ad82c7e22be35753c9e164b4bdd30f92db4aee17a0d4c94c5f902f

Utiliser ce paquet

OpenFactory peut démarrer ce système d'exploitation dans une machine virtuelle du navigateur, ou lancer une construction qui inclut le nom natif du paquet de cet enregistrement.

Essayer openSUSE Tumbleweed dans le navigateurConstruire une image qui inclut htsfile

Versions, suites et dépôts

Chaque ligne est une métadonnée d'index pour une version, une architecture, une suite et un dépôt. Noms, URL et tailles viennent de la source ; un lien est un emplacement de récupération mutable, pas une redistribution OpenFactory.

VersionReleaseArchitectureRepositoryPackage sizeInstalled sizePublisher repository artifact
1.21-1.5tumbleweed / ossx86_64openSUSE Tumbleweed · OSS · multi-architecture449 KiB1.2 MiBx86_64/htsfile-1.21-1.5.x86_64.rpm

Field source: openSUSE Tumbleweed OSS revision tumbleweed-oss-multiarch:4db10cdde3ad82c7e22be35753c9e164b4bdd30f92db4aee17a0d4c94c5f902f

Empreintes et dates d'observation

For an APT source, signature verification authenticates the repository metadata chain and the Packages index containing this source-reported artifact digest. It does not certify package safety.

Complétude de la fiche

The completeness score measures metadata coverage, not software quality, security, compatibility, or suitability.

Summary and description
25/25
Artifact path and source digest
25/25
Dependency metadata
15/15
Package-file index
15/15
Homepage
5/5
License text
5/5
Source package or maintainer
10/10

Recorded total: 100/100

Field source: openSUSE Tumbleweed OSS revision tumbleweed-oss-multiarch:4db10cdde3ad82c7e22be35753c9e164b4bdd30f92db4aee17a0d4c94c5f902f. The cross-OS mapping is catalog-derived from the source-reported homepage; it does not establish authorship or publisher identity

Sources et provenance

Field-source links above resolve here. Each source entry names the metadata publisher, trust tier, exact snapshot revision, signature result, and observation time; catalog-derived mappings are labeled separately.

  • openSUSE Tumbleweed OSSSep 1, 2026

    Authoritative source; repository metadata signature verified, revision tumbleweed-oss-multiarch:4db10cdde3ad82c7e22be35753c9e164b4bdd30f92db4aee17a0d4c94c5f902f

    Signature verification covers the configured repository metadata chain. It does not certify that the package is safe or suitable.

    Repository-signature verification record
    Signed-object SHA-256
    4db10cdde3ad82c7e22be35753c9e164b4bdd30f92db4aee17a0d4c94c5f902f
    Signer fingerprint
    AD485664E901B867051AB15F35A2F86E29B700A4
    Keyring revision
    opensuse-project-signing-key.asc
    SHA-256 b5745739ebfb95b25b8e810f9bcb847fe750ccda598bd85f02f0e974599a6d7e
    Tool and policy
    gpgv (GnuPG) 2.4.9
    openfactory-software-catalog-signature-v1
    Verification time
    Sep 1, 2026
    Signed Release → package-index hash linkage

    Path: Not recorded
    Expected SHA-256: Not recorded
    Observed SHA-256: Not recorded
    Result: match verified

htsfile Package for openSUSE Tumbleweed | OpenFactory