Packages / openSUSE Leap 15.6 / Productivity/Scientific/Other / bcftools

Package: bcftools (1.16-bp156.2.8)

Засоби для роботи з варіантними викликами у форматі Variant Call Format (VCF)

Пакет для нових BCFtools: набір утиліт для маніпуляції варіантними викликами у форматі Variant Call Format (VCF) та його двійковому аналозі BCF. Містить усі команди «vcf...», які раніше жили в репозиторії HTSlib (наприклад vcfcheck, vcfmerge, vcfisec тощо), а також виклик BCF з samtools із підкаталогу bcftools samtools. BCFtools задумані як швидша заміна більшості perl-команд VCFtools.

Other Packages Related to bcftools:

dep: /usr/bin/perl
Package not available
dep: /usr/bin/python3
Package not available
dep: [bgzip]
Утиліта блокового стиснення/розпакування з проєкту HTSlib
dep: [htsfile]
Ідентифікувати файли даних секвенування з високою пропускною здатністю з проєкту HTSlib
dep: ld-linux-aarch64.so.1()(64bit)
Package not available
dep: ld-linux-aarch64.so.1(GLIBC_2.17)(64bit)
Package not available
dep: libhts.so.3()(64bit)
Package not available
dep: libm.so.6()(64bit)
Package not available
dep: libm.so.6(GLIBC_2.17)(64bit)
Package not available
dep: libm.so.6(GLIBC_2.23)(64bit)
Package not available
dep: libm.so.6(GLIBC_2.29)(64bit)
Package not available
dep: [perl]
Інтерпретатор Perl
dep: [python3-base]
Python 3 Interpreter and Stdlib Core
dep: [python3-matplotlib]
Бібліотека побудови графіків для Python
dep: [tabix]
Універсальний індексатор для TAB-розділених файлів геномних позицій з проєкту HTSlib
dep: libc.so.6(GLIBC_2.34)(64bit)
Package not available

Download bcftools

Architecture	Package size	Installed size	Files	Package
aarch64	706 KiB	4.0 MiB	list of files	Download
ppc64le	798 KiB	4.3 MiB	list of files	Download
s390x	696 KiB	2.5 MiB	list of files	Download
x86_64	755 KiB	2.3 MiB	list of files	Download

Шляхи файлів пакета (54)

Paths come from the repository package-file index for the observed builds. They describe archive/package associations, not every file that will exist on a running system after maintainer scripts, alternatives, generated state, diversions, or installation choices.

/usr/bin/bcftools
/usr/bin/color-chrs.pl
/usr/bin/gff2gff.py
/usr/bin/guess-ploidy.py
/usr/bin/plot-roh.py
/usr/bin/plot-vcfstats
/usr/bin/run-roh.pl
/usr/bin/vcfutils.pl
/usr/lib64/bcftools
/usr/lib64/bcftools/ad-bias.so
/usr/lib64/bcftools/add-variantkey.so
/usr/lib64/bcftools/af-dist.so
/usr/lib64/bcftools/allele-length.so
/usr/lib64/bcftools/check-ploidy.so
/usr/lib64/bcftools/check-sparsity.so
/usr/lib64/bcftools/color-chrs.so
/usr/lib64/bcftools/contrast.so
/usr/lib64/bcftools/counts.so
/usr/lib64/bcftools/dosage.so
/usr/lib64/bcftools/fill-AN-AC.so
/usr/lib64/bcftools/fill-from-fasta.so
/usr/lib64/bcftools/fill-tags.so
/usr/lib64/bcftools/fixploidy.so
/usr/lib64/bcftools/fixref.so
/usr/lib64/bcftools/frameshifts.so
/usr/lib64/bcftools/GTisec.so
/usr/lib64/bcftools/GTsubset.so
/usr/lib64/bcftools/guess-ploidy.so
/usr/lib64/bcftools/gvcfz.so
/usr/lib64/bcftools/impute-info.so
/usr/lib64/bcftools/indel-stats.so
/usr/lib64/bcftools/isecGT.so
/usr/lib64/bcftools/mendelian.so
/usr/lib64/bcftools/missing2ref.so
/usr/lib64/bcftools/parental-origin.so
/usr/lib64/bcftools/prune.so
/usr/lib64/bcftools/remove-overlaps.so
/usr/lib64/bcftools/scatter.so
/usr/lib64/bcftools/setGT.so
/usr/lib64/bcftools/smpl-stats.so
/usr/lib64/bcftools/split.so
/usr/lib64/bcftools/split-vep.so
/usr/lib64/bcftools/tag2tag.so
/usr/lib64/bcftools/trio-dnm2.so
/usr/lib64/bcftools/trio-stats.so
/usr/lib64/bcftools/trio-switch-rate.so
/usr/lib64/bcftools/variant-distance.so
/usr/lib64/bcftools/variantkey-hex.so
/usr/share/doc/packages/bcftools
/usr/share/doc/packages/bcftools/AUTHORS
/usr/share/doc/packages/bcftools/README
/usr/share/licenses/bcftools
/usr/share/licenses/bcftools/LICENSE
/usr/share/man/man1/bcftools.1.gz

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

Використати цей пакет

OpenFactory може завантажити цю операційну систему у віртуальній машині браузера або почати збірку образу з рідною назвою пакета з цього запису.

Спробувати openSUSE Leap 15.6 у браузері Зібрати образ, що містить bcftools

Версії, набори та репозиторії

Кожен рядок: метадані індексу пакетів для однієї версії, архітектури, набору й репозиторію. Назви, URL і розміри зі джерела; посилання є змінним місцем отримання, не перерозповсюдженням OpenFactory.

Version	Release	Architecture	Repository	Package size	Installed size	Publisher repository artifact
1.16-bp156.2.8	leap-15.6 / oss	aarch64	openSUSE Leap 15.6 · OSS · multi-architecture	706 KiB	4.0 MiB	aarch64/bcftools-1.16-bp156.2.8.aarch64.rpm
1.16-bp156.2.8	leap-15.6 / oss	ppc64le	openSUSE Leap 15.6 · OSS · multi-architecture	798 KiB	4.3 MiB	ppc64le/bcftools-1.16-bp156.2.8.ppc64le.rpm
1.16-bp156.2.8	leap-15.6 / oss	s390x	openSUSE Leap 15.6 · OSS · multi-architecture	696 KiB	2.5 MiB	s390x/bcftools-1.16-bp156.2.8.s390x.rpm
1.16-bp156.2.8	leap-15.6 / oss	x86_64	openSUSE Leap 15.6 · OSS · multi-architecture	755 KiB	2.3 MiB	x86_64/bcftools-1.16-bp156.2.8.x86_64.rpm

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

Відомі вразливості

У відстежуваних джерелах немає відповідних повідомлень.

Остання синхронізація: Oct 29, 2026, 6:50:51 PM UTC

[Каталог CVE]

Контрольні суми

Repository signatures authenticate metadata. Artifact hashing is recorded separately. Neither establishes package safety.

1.16-bp156.2.8 / aarch64Спостережено Sep 1, 2026sha512 aebe60c9c779…c72e9ed7Контрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha512): aebe60c9c77932a0379ff02165e9aaf4bbe9a4c9a73e8b1b35a043129466ecf75c93df0d89d8857827a865ddb0f982bf11188ac0195f24be5230ef00c72e9ed7

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

1.16-bp156.2.8 / ppc64leСпостережено Sep 1, 2026sha512 3fc8d4e12b8f…05dda1b1Контрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha512): 3fc8d4e12b8f391147297c86fce5e8e6e7ef7ad44afac42d2fa32b61fa7dda50108b6a4e665525983e509beef99554588bf8cf061cfba57ebfe312d705dda1b1

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

1.16-bp156.2.8 / s390xСпостережено Sep 1, 2026sha512 47d6fd8956ba…06e7b0cfКонтрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha512): 47d6fd8956ba7961f41e8914055121316f291326a1ca11afa6b6d70db8f4cbc50a9a6049f9da54c65bb269bc1249fc1bd21997da6f55fa6196b168db06e7b0cf

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

1.16-bp156.2.8 / x86_64Спостережено Sep 1, 2026sha512 0b7d3b36d2a5…c4200a61Контрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha512): 0b7d3b36d2a547605b2422f05aa7b26d5cb027a0306ab066b3e39465fcb81908b557e8e93e0f5424c818b9b37000a474ef5726b90de24c7a83a82d91c4200a61

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

Джерела

openSUSE Leap 15.6 OSSSep 1, 2026
Authoritative source; repository metadata signature verified
Доказ підпису
leap-15-6-oss-multiarch:ca2653101b9afba6656aea529109ba0c0f1ca1a92aa8614e7c887fda5264c230
Repository-signature verification record
Signed object
https://download.opensuse.org/distribution/leap/15.6/repo/oss/repodata/repomd.xml
Signed-object SHA-256
ca2653101b9afba6656aea529109ba0c0f1ca1a92aa8614e7c887fda5264c230
Signer fingerprint
AD485664E901B867051AB15F35A2F86E29B700A4
Keyring revision
opensuse-project-signing-key.asc
SHA-256 b5745739ebfb95b25b8e810f9bcb847fe750ccda598bd85f02f0e974599a6d7e
Tool and policy
gpgv (GnuPG) 2.4.9
openfactory-software-catalog-signature-v1
Verification time
Sep 1, 2026
Repository metadata hash linkage
Result
Recorded as verified; digest details unavailable