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[Source: bowtie2]

Package: bowtie2 (2.5.1-bp156.2.24)

Aligneur de lectures courtes rapide et économe en mémoire

Bowtie 2 est un outil ultra-rapide et économe en mémoire pour aligner des lectures de séquençage sur de longues séquences de référence. Il est particulièrement efficace pour aligner des lectures d’environ 50 jusqu’à des centaines ou des milliers de caractères, et particulièrement efficace pour l’alignement sur des génomes relativement longs (par ex. de mammifères). Bowtie 2 indexe le génome avec un FM Index afin de limiter son empreinte mémoire : pour le génome humain, son empreinte mémoire est typiquement d’environ 3,2 Go. Bowtie 2 prend en charge les modes d’alignement gapped, local et paired-end.

Other Packages Related to bowtie2:

  • dep: /usr/bin/perl

    Package not available

  • dep: /usr/bin/python3

    Package not available

  • dep: ld-linux-aarch64.so.1()(64bit)

    Package not available

  • dep: ld-linux-aarch64.so.1(GLIBC_2.17)(64bit)

    Package not available

  • dep: libgcc_s.so.1()(64bit)

    Package not available

  • dep: libgcc_s.so.1(GCC_3.0)(64bit)

    Package not available

  • dep: libm.so.6()(64bit)

    Package not available

  • dep: libm.so.6(GLIBC_2.17)(64bit)

    Package not available

  • dep: libm.so.6(GLIBC_2.29)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6()(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(CXXABI_1.3)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.11)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.2)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.3)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.8)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.11)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.14)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.15)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.20)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.21)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.22)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.30)(64bit)

    Package not available

  • dep: libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.9)(64bit)

    Package not available

  • dep: libz.so.1()(64bit)

    Package not available

  • dep: libz.so.1(ZLIB_1.2.0.2)(64bit)

    Package not available

  • dep: libz.so.1(ZLIB_1.2.3.3)(64bit)

    Package not available

  • dep: libz.so.1(ZLIB_1.2.3.5)(64bit)

    Package not available

  • dep: libc.so.6(GLIBC_2.38)(64bit)

    Package not available

Download bowtie2

ArchitecturePackage sizeInstalled sizeFilesPackage
aarch64858 KiB4.7 MiBlist of filesDownload
s390x767 KiB5.1 MiBlist of filesDownload
x86_64857 KiB5.3 MiBlist of filesDownload

Chemins de fichiers du paquet (18)

Paths come from the repository package-file index for the observed builds. They describe archive/package associations, not every file that will exist on a running system after maintainer scripts, alternatives, generated state, diversions, or installation choices.

  • /usr/bin/bowtie2
  • /usr/bin/bowtie2-align-l
  • /usr/bin/bowtie2-align-s
  • /usr/bin/bowtie2-build
  • /usr/bin/bowtie2-build-l
  • /usr/bin/bowtie2-build-s
  • /usr/bin/bowtie2-inspect
  • /usr/bin/bowtie2-inspect-l
  • /usr/bin/bowtie2-inspect-s
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/AUTHORS
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/BOWTIE2_VERSION
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/MANUAL
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/NEWS
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/README.md
  • /usr/share/doc/packages/bowtie2/TUTORIAL
  • /usr/share/licenses/bowtie2
  • /usr/share/licenses/bowtie2/LICENSE

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

Utiliser ce paquet

OpenFactory peut démarrer ce système d'exploitation dans une machine virtuelle du navigateur, ou lancer une construction qui inclut le nom natif du paquet de cet enregistrement.

Essayer openSUSE Leap 15.6 dans le navigateurConstruire une image qui inclut bowtie2

Versions, suites et dépôts

Chaque ligne est une métadonnée d'index pour une version, une architecture, une suite et un dépôt. Noms, URL et tailles viennent de la source ; un lien est un emplacement de récupération mutable, pas une redistribution OpenFactory.

VersionReleaseArchitectureRepositoryPackage sizeInstalled sizePublisher repository artifact
2.5.1-bp156.2.24leap-15.6 / ossaarch64openSUSE Leap 15.6 · OSS · multi-architecture858 KiB4.7 MiBaarch64/bowtie2-2.5.1-bp156.2.24.aarch64.rpm
2.5.1-bp156.2.24leap-15.6 / osss390xopenSUSE Leap 15.6 · OSS · multi-architecture767 KiB5.1 MiBs390x/bowtie2-2.5.1-bp156.2.24.s390x.rpm
2.5.1-bp156.2.24leap-15.6 / ossx86_64openSUSE Leap 15.6 · OSS · multi-architecture857 KiB5.3 MiBx86_64/bowtie2-2.5.1-bp156.2.24.x86_64.rpm

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

Vulnérabilités connues

Aucun avis correspondant dans les sources suivies.

Dernière synchronisation:

[Catalogue CVE]

Empreintes

Repository signatures authenticate metadata. Artifact hashing is recorded separately. Neither establishes package safety.

2.5.1-bp156.2.24 / aarch64Observé Sep 1, 2026sha512 0898092893a9…6f2f7487Empreinte publiée par la source

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Empreinte publiée par la source (sha512): 0898092893a9f469aebaf5cb6dffc352ddd0dce4f14b2c529008ee0bc5036a337615fb8d836e3f6b50378d0e7b56de49249aaf7f6af9281f3a956f746f2f7487

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

2.5.1-bp156.2.24 / s390xObservé Sep 1, 2026sha512 a60d40f1bf98…01d3e4d0Empreinte publiée par la source

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Empreinte publiée par la source (sha512): a60d40f1bf985899e1737b39985c91a3527c371463308ffb05b1fba30bae38ea2f2f53114e64e04613a79522f494a5b2a086ea999ee22c33fb20effc01d3e4d0

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

2.5.1-bp156.2.24 / x86_64Observé Sep 1, 2026sha512 ceb3dcc7481f…50aed019Empreinte publiée par la source

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Empreinte publiée par la source (sha512): ceb3dcc7481fdaa999cfd6e30c186962daf1005c69d14755199c4fd4b3184e872b22b13a355dbf4a446c4de8b708d4ff6974332ddb0a3e80219c791750aed019

Field source: openSUSE Leap 15.6 OSS

Sources

  • openSUSE Leap 15.6 OSSSep 1, 2026

    Authoritative source; repository metadata signature verified

    Preuve de signature

    leap-15-6-oss-multiarch:ca2653101b9afba6656aea529109ba0c0f1ca1a92aa8614e7c887fda5264c230

    Repository-signature verification record
    Signed-object SHA-256
    ca2653101b9afba6656aea529109ba0c0f1ca1a92aa8614e7c887fda5264c230
    Signer fingerprint
    AD485664E901B867051AB15F35A2F86E29B700A4
    Keyring revision
    opensuse-project-signing-key.asc
    SHA-256 b5745739ebfb95b25b8e810f9bcb847fe750ccda598bd85f02f0e974599a6d7e
    Tool and policy
    gpgv (GnuPG) 2.4.9
    openfactory-software-catalog-signature-v1
    Verification time
    Sep 1, 2026
    Repository metadata hash linkage
    Result
    Recorded as verified; digest details unavailable