Packages / Debian 12 (Bookworm) / libdevel / libhts-dev

Package: libhts-dev (1.16+ds-3)

development files for the HTSlib

Other Packages Related to libhts-dev:

  • dep: [libhts3] (= 1.16+ds-3)

    C library for high-throughput sequencing data formats

  • dep: [libcurl4-gnutls-dev]

    файли розробки та документація для libcurl (варіант GnuTLS)

  • dep: [libdeflate-dev]

    headers for whole-buffer compression and decompression library

  • dep: [liblzma-dev]

    XZ-format compression library - development files

  • dep: [zlib1g-dev]

    compression library - development

Download libhts-dev

ArchitecturePackage sizeInstalled sizeFilesPackage
amd641.5 MiB6.4 MiBlist of filesDownload
arm641.5 MiB6.1 MiBlist of filesDownload

Шляхи файлів пакета (40)

Paths come from the repository package-file index for the observed builds. They describe archive/package associations, not every file that will exist on a running system after maintainer scripts, alternatives, generated state, diversions, or installation choices.

  • /usr/include/htslib/bgzf.h
  • /usr/include/htslib/cram.h
  • /usr/include/htslib/faidx.h
  • /usr/include/htslib/hfile.h
  • /usr/include/htslib/hts_defs.h
  • /usr/include/htslib/hts_endian.h
  • /usr/include/htslib/hts_expr.h
  • /usr/include/htslib/hts.h
  • /usr/include/htslib/hts_log.h
  • /usr/include/htslib/hts_os.h
  • /usr/include/htslib/kbitset.h
  • /usr/include/htslib/kfunc.h
  • /usr/include/htslib/khash.h
  • /usr/include/htslib/khash_str2int.h
  • /usr/include/htslib/klist.h
  • /usr/include/htslib/knetfile.h
  • /usr/include/htslib/kroundup.h
  • /usr/include/htslib/kseq.h
  • /usr/include/htslib/ksort.h
  • /usr/include/htslib/kstring.h
  • /usr/include/htslib/regidx.h
  • /usr/include/htslib/sam.h
  • /usr/include/htslib/synced_bcf_reader.h
  • /usr/include/htslib/tbx.h
  • /usr/include/htslib/thread_pool.h
  • /usr/include/htslib/vcf.h
  • /usr/include/htslib/vcf_sweep.h
  • /usr/include/htslib/vcfutils.h
  • /usr/lib/aarch64-linux-gnu/libhts.a
  • /usr/lib/aarch64-linux-gnu/libhts.so
  • /usr/lib/aarch64-linux-gnu/pkgconfig/htslib.pc
  • /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhts.a
  • /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhts.so
  • /usr/lib/x86_64-linux-gnu/pkgconfig/htslib.pc
  • /usr/share/doc/libhts-dev/changelog.Debian.gz
  • /usr/share/doc/libhts-dev/changelog.gz
  • /usr/share/doc/libhts-dev/copyright
  • /usr/share/doc/libhts-dev/README
  • /usr/share/doc/libhts-dev/README.large_positions.md.gz
  • /usr/share/doc/libhts-dev/README.test

Field source: Debian 12 (Bookworm) main amd64

Використати цей пакет

OpenFactory може завантажити цю операційну систему у віртуальній машині браузера або почати збірку образу з рідною назвою пакета з цього запису.

Версії, набори та репозиторії

Кожен рядок: метадані індексу пакетів для однієї версії, архітектури, набору й репозиторію. Назви, URL і розміри зі джерела; посилання є змінним місцем отримання, не перерозповсюдженням OpenFactory.

VersionReleaseArchitectureRepositoryPackage sizeInstalled sizePublisher repository artifact
1.16+ds-3bookworm / mainamd64Debian 12 · main · amd641.5 MiB6.4 MiBpool/main/h/htslib/libhts-dev_1.16+ds-3_amd64.deb
1.16+ds-3bookworm / mainarm64Debian 12 · main · arm641.5 MiB6.1 MiBpool/main/h/htslib/libhts-dev_1.16+ds-3_arm64.deb

Field source: Debian 12 (Bookworm) main amd64

Відомі вразливості

Зіставлення пакетів триває.

CVEКритичністьВплив на версії
[CVE-2026-116742]

Published:

htslib: CVE-2026-116742

MediumУражена
Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    dsa · htslib · debian · bookworm

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    dsa · htslib · debian · bookworm

[CVE-2026-31971]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. When

High(7.3)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31970]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. GZI files are used to index block-compressed GZIP [BGZF] files. In the GZI loading function, `bgzf_index_load_hfile()`, it was

High(7.3)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31969]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. Whe

High(7.3)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31968]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. For

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31967]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. In the `cram_decode_slice()` function called while readin

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31966]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. As one method of removing redundant data, CRAM uses refer

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31965]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. In the `cram_decode_slice()` function called while readin

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31964]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. Whi

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31963]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. As one method of removing redundant data, CRAM uses refer

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31962]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. While most alignment records store DNA sequence and quali

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2020-36403]

Published:

htslib: CVE-2020-36403

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.11-1

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.11-1

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2018-14329]

Published:

htslib: CVE-2018-14329

LowНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2018-13844]

Published:

htslib: CVE-2018-13844

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2018-13843]

Published:

htslib: CVE-2018-13843

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2018-13845]

Published:

htslib: CVE-2018-13845

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2017-1000206]

Published:

htslib: CVE-2017-1000206

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.4.1-1

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.4.1-1

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

Остання синхронізація:

[Каталог CVE]

Контрольні суми

Repository signatures authenticate metadata. Artifact hashing is recorded separately. Neither establishes package safety.

1.16+ds-3 / amd64Спостережено Sep 1, 2026sha256 044d6f62ee5e…ac237206Контрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha256): 044d6f62ee5eeb4183bf00163ba3006a4a19a8029975584537a7d2ecac237206

Перевірити завантаження

printf '%s %s\n' '044d6f62ee5eeb4183bf00163ba3006a4a19a8029975584537a7d2ecac237206' 'libhts-dev_1.16+ds-3_amd64.deb' | sha256sum --check --strict -

Field source: Debian 12 (Bookworm) main amd64

1.16+ds-3 / arm64Спостережено Sep 1, 2026sha256 9c124cf1609c…8916c1b1Контрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha256): 9c124cf1609c85523f4fb3da35cf6cc54c35bf9848ba169c1cc7c9928916c1b1

Перевірити завантаження

printf '%s %s\n' '9c124cf1609c85523f4fb3da35cf6cc54c35bf9848ba169c1cc7c9928916c1b1' 'libhts-dev_1.16+ds-3_arm64.deb' | sha256sum --check --strict -

Field source: Debian 12 (Bookworm) main arm64

Джерела

  • Authoritative source; repository metadata signature verified

    Доказ підпису

    bookworm-main-amd64:9e0b5aabb2465b3d2e7a7fe27f9913846277833f7a2826e7767acccff5b588c5

    Repository-signature verification record
    Signed-object SHA-256
    77737fa4b34f2693e982cc9ee35736816c35a7778fc2d326cc1bbf5b301fe1aa
    Signer fingerprint
    4CB50190207B4758A3F73A796ED0E7B82643E131
    Keyring revision
    debian-archive-keyring.gpg
    SHA-256 506b815cbb32d9b6066b4a2aa524071e071761e7e7f68c3ac74f3061ba852017
    Tool and policy
    gpgv (GnuPG) 2.4.9
    openfactory-software-catalog-signature-v1
    Verification time
    Sep 1, 2026
    Repository metadata hash linkage
    Path
    main/binary-amd64/Packages.xz
    Expected SHA-256
    9e0b5aabb2465b3d2e7a7fe27f9913846277833f7a2826e7767acccff5b588c5
    Observed SHA-256
    9e0b5aabb2465b3d2e7a7fe27f9913846277833f7a2826e7767acccff5b588c5
    Result
    match verified
  • Authoritative source; repository metadata signature verified

    Доказ підпису

    bookworm-main-arm64:2ddb1737692e8c45c53e8d57c0ce4cd21c78c5703b830c3226b1423566a06c00

    Repository-signature verification record
    Signed-object SHA-256
    77737fa4b34f2693e982cc9ee35736816c35a7778fc2d326cc1bbf5b301fe1aa
    Signer fingerprint
    4CB50190207B4758A3F73A796ED0E7B82643E131
    Keyring revision
    debian-archive-keyring.gpg
    SHA-256 506b815cbb32d9b6066b4a2aa524071e071761e7e7f68c3ac74f3061ba852017
    Tool and policy
    gpgv (GnuPG) 2.4.9
    openfactory-software-catalog-signature-v1
    Verification time
    Sep 1, 2026
    Repository metadata hash linkage
    Path
    main/binary-arm64/Packages.xz
    Expected SHA-256
    2ddb1737692e8c45c53e8d57c0ce4cd21c78c5703b830c3226b1423566a06c00
    Observed SHA-256
    2ddb1737692e8c45c53e8d57c0ce4cd21c78c5703b830c3226b1423566a06c00
    Result
    match verified