Packages / Debian 12 (Bookworm) / libs / libhts3

Package: libhts3 (1.16+ds-3)

C library for high-throughput sequencing data formats

Other Packages Related to libhts3:

  • dep: [libbz2-1.0]

    high-quality block-sorting file compressor library - runtime

  • dep: [libc6] (>= 2.34)

    GNU C Library: Shared libraries

  • dep: [libcurl3-gnutls] (>= 7.18.0)

    проста у використанні клієнтська бібліотека передачі URL (варіант GnuTLS)

  • dep: [libdeflate0] (>= 1.0)

    fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

  • dep: [libhtscodecs2] (>= 1.3.0)

    Custom compression for CRAM and others

  • dep: [liblzma5] (>= 5.1.1alpha+20120614)

    XZ-format compression library

  • dep: [libssl3] (>= 3.0.0)

    набір інструментів Secure Sockets Layer — спільні бібліотеки

  • dep: [zlib1g] (>= 1:1.1.4)

    compression library - runtime

Download libhts3

ArchitecturePackage sizeInstalled sizeFilesPackage
amd64419 KiB1.0 MiBlist of filesDownload
arm64383 KiB1.2 MiBlist of filesDownload

Шляхи файлів пакета (19)

Paths come from the repository package-file index for the observed builds. They describe archive/package associations, not every file that will exist on a running system after maintainer scripts, alternatives, generated state, diversions, or installation choices.

  • /usr/lib/aarch64-linux-gnu/htslib/hfile_gcs.so
  • /usr/lib/aarch64-linux-gnu/htslib/hfile_libcurl.so
  • /usr/lib/aarch64-linux-gnu/htslib/hfile_s3.so
  • /usr/lib/aarch64-linux-gnu/htslib/hfile_s3_write.so
  • /usr/lib/aarch64-linux-gnu/libhts.so.1.16
  • /usr/lib/aarch64-linux-gnu/libhts.so.3
  • /usr/lib/x86_64-linux-gnu/htslib/hfile_gcs.so
  • /usr/lib/x86_64-linux-gnu/htslib/hfile_libcurl.so
  • /usr/lib/x86_64-linux-gnu/htslib/hfile_s3.so
  • /usr/lib/x86_64-linux-gnu/htslib/hfile_s3_write.so
  • /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhts.so.1.16
  • /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhts.so.3
  • /usr/share/doc/libhts3/changelog.Debian.gz
  • /usr/share/doc/libhts3/changelog.gz
  • /usr/share/doc/libhts3/copyright
  • /usr/share/man/man5/faidx.5.gz
  • /usr/share/man/man5/sam.5.gz
  • /usr/share/man/man5/vcf.5.gz
  • /usr/share/man/man7/htslib-s3-plugin.7.gz

Field source: Debian 12 (Bookworm) main amd64

Використати цей пакет

OpenFactory може завантажити цю операційну систему у віртуальній машині браузера або почати збірку образу з рідною назвою пакета з цього запису.

Версії, набори та репозиторії

Кожен рядок: метадані індексу пакетів для однієї версії, архітектури, набору й репозиторію. Назви, URL і розміри зі джерела; посилання є змінним місцем отримання, не перерозповсюдженням OpenFactory.

VersionReleaseArchitectureRepositoryPackage sizeInstalled sizePublisher repository artifact
1.16+ds-3bookworm / mainamd64Debian 12 · main · amd64419 KiB1.0 MiBpool/main/h/htslib/libhts3_1.16+ds-3_amd64.deb
1.16+ds-3bookworm / mainarm64Debian 12 · main · arm64383 KiB1.2 MiBpool/main/h/htslib/libhts3_1.16+ds-3_arm64.deb

Field source: Debian 12 (Bookworm) main amd64

Відомі вразливості

Зіставлення пакетів триває.

CVEКритичністьВплив на версії
[CVE-2026-116742]

Published:

htslib: CVE-2026-116742

MediumУражена
Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    dsa · htslib · debian · bookworm

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    dsa · htslib · debian · bookworm

[CVE-2026-31971]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. When

High(7.3)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31970]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. GZI files are used to index block-compressed GZIP [BGZF] files. In the GZI loading function, `bgzf_index_load_hfile()`, it was

High(7.3)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31969]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. Whe

High(7.3)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31968]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. For

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31967]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. In the `cram_decode_slice()` function called while readin

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31966]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. As one method of removing redundant data, CRAM uses refer

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31965]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. In the `cram_decode_slice()` function called while readin

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31964]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. Whi

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31963]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. As one method of removing redundant data, CRAM uses refer

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2026-31962]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. While most alignment records store DNA sequence and quali

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    nvd · htslib · debian · bookworm; nvd · htslib · debian · 12

[CVE-2020-36403]

Published:

htslib: CVE-2020-36403

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.11-1

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.11-1

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2018-14329]

Published:

htslib: CVE-2018-14329

LowНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Уражена

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Уражена

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2018-13844]

Published:

htslib: CVE-2018-13844

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2018-13843]

Published:

htslib: CVE-2018-13843

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2018-13845]

Published:

htslib: CVE-2018-13845

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

[CVE-2017-1000206]

Published:

htslib: CVE-2017-1000206

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.16+ds-3 · amd64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.4.1-1

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

  • 1.16+ds-3 · arm64 · bookworm

    Виправлена · Виправлена: 1.4.1-1

    dsa · htslib · debian · bookworm; dsa · htslib · debian · 12

Остання синхронізація:

[Каталог CVE]

Контрольні суми

Repository signatures authenticate metadata. Artifact hashing is recorded separately. Neither establishes package safety.

1.16+ds-3 / amd64Спостережено Sep 1, 2026sha256 022276ea286c…5c37e037Контрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha256): 022276ea286c391b8308e09a64cae1402b87b560aff413914f277bb75c37e037

Перевірити завантаження

printf '%s %s\n' '022276ea286c391b8308e09a64cae1402b87b560aff413914f277bb75c37e037' 'libhts3_1.16+ds-3_amd64.deb' | sha256sum --check --strict -

Field source: Debian 12 (Bookworm) main amd64

1.16+ds-3 / arm64Спостережено Sep 1, 2026sha256 ab3ee36256fd…aa57dc24Контрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha256): ab3ee36256fddc5fc9a4fa3e58eb4003a252920243dc6019229dc0b9aa57dc24

Перевірити завантаження

printf '%s %s\n' 'ab3ee36256fddc5fc9a4fa3e58eb4003a252920243dc6019229dc0b9aa57dc24' 'libhts3_1.16+ds-3_arm64.deb' | sha256sum --check --strict -

Field source: Debian 12 (Bookworm) main arm64

Джерела

  • Authoritative source; repository metadata signature verified

    Доказ підпису

    bookworm-main-amd64:9e0b5aabb2465b3d2e7a7fe27f9913846277833f7a2826e7767acccff5b588c5

    Repository-signature verification record
    Signed-object SHA-256
    77737fa4b34f2693e982cc9ee35736816c35a7778fc2d326cc1bbf5b301fe1aa
    Signer fingerprint
    4CB50190207B4758A3F73A796ED0E7B82643E131
    Keyring revision
    debian-archive-keyring.gpg
    SHA-256 506b815cbb32d9b6066b4a2aa524071e071761e7e7f68c3ac74f3061ba852017
    Tool and policy
    gpgv (GnuPG) 2.4.9
    openfactory-software-catalog-signature-v1
    Verification time
    Sep 1, 2026
    Repository metadata hash linkage
    Path
    main/binary-amd64/Packages.xz
    Expected SHA-256
    9e0b5aabb2465b3d2e7a7fe27f9913846277833f7a2826e7767acccff5b588c5
    Observed SHA-256
    9e0b5aabb2465b3d2e7a7fe27f9913846277833f7a2826e7767acccff5b588c5
    Result
    match verified
  • Authoritative source; repository metadata signature verified

    Доказ підпису

    bookworm-main-arm64:2ddb1737692e8c45c53e8d57c0ce4cd21c78c5703b830c3226b1423566a06c00

    Repository-signature verification record
    Signed-object SHA-256
    77737fa4b34f2693e982cc9ee35736816c35a7778fc2d326cc1bbf5b301fe1aa
    Signer fingerprint
    4CB50190207B4758A3F73A796ED0E7B82643E131
    Keyring revision
    debian-archive-keyring.gpg
    SHA-256 506b815cbb32d9b6066b4a2aa524071e071761e7e7f68c3ac74f3061ba852017
    Tool and policy
    gpgv (GnuPG) 2.4.9
    openfactory-software-catalog-signature-v1
    Verification time
    Sep 1, 2026
    Repository metadata hash linkage
    Path
    main/binary-arm64/Packages.xz
    Expected SHA-256
    2ddb1737692e8c45c53e8d57c0ce4cd21c78c5703b830c3226b1423566a06c00
    Observed SHA-256
    2ddb1737692e8c45c53e8d57c0ce4cd21c78c5703b830c3226b1423566a06c00
    Result
    match verified