Packages / Debian 13 (Trixie) / science / tabix

Package: tabix (1.21+ds-1)

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Other Packages Related to tabix:

  • dep: [libbz2-1.0]

    high-quality block-sorting file compressor library - runtime

  • dep: [libc6] (>= 2.34)

    GNU C Library: Shared libraries

  • dep: [libdeflate0] (>= 1.0)

    fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

  • dep: [libhtscodecs2] (>= 1.3.0)

    Custom compression for CRAM and others

  • dep: [liblzma5] (>= 5.1.1alpha+20120614)

    XZ-format compression library

  • dep: [zlib1g] (>= 1:1.1.4)

    compression library - runtime

Download tabix

ArchitecturePackage sizeInstalled sizeFilesPackage
amd64484 KiB2.3 MiBlist of filesDownload
arm64450 KiB2.3 MiBlist of filesDownload

Шляхи файлів пакета (9)

Paths come from the repository package-file index for the observed builds. They describe archive/package associations, not every file that will exist on a running system after maintainer scripts, alternatives, generated state, diversions, or installation choices.

  • /usr/bin/bgzip
  • /usr/bin/htsfile
  • /usr/bin/tabix
  • /usr/share/doc/tabix/changelog.Debian.gz
  • /usr/share/doc/tabix/changelog.gz
  • /usr/share/doc/tabix/copyright
  • /usr/share/man/man1/bgzip.1.gz
  • /usr/share/man/man1/htsfile.1.gz
  • /usr/share/man/man1/tabix.1.gz

Field source: Debian 13 (Trixie) main amd64

Використати цей пакет

OpenFactory може завантажити цю операційну систему у віртуальній машині браузера або почати збірку образу з рідною назвою пакета з цього запису.

Версії, набори та репозиторії

Кожен рядок: метадані індексу пакетів для однієї версії, архітектури, набору й репозиторію. Назви, URL і розміри зі джерела; посилання є змінним місцем отримання, не перерозповсюдженням OpenFactory.

VersionReleaseArchitectureRepositoryPackage sizeInstalled sizePublisher repository artifact
1.21+ds-1trixie / mainamd64Debian 13 · main · amd64484 KiB2.3 MiBpool/main/h/htslib/tabix_1.21+ds-1_amd64.deb
1.21+ds-1trixie / mainarm64Debian 13 · main · arm64450 KiB2.3 MiBpool/main/h/htslib/tabix_1.21+ds-1_arm64.deb

Field source: Debian 13 (Trixie) main amd64

Відомі вразливості

Зіставлення пакетів триває.

CVEКритичністьВплив на версії
[CVE-2026-31971]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. When

High(7.3)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2026-31970]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. GZI files are used to index block-compressed GZIP [BGZF] files. In the GZI loading function, `bgzf_index_load_hfile()`, it was

High(7.3)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2026-31969]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. Whe

High(7.3)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2026-31968]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. For

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2026-31967]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. In the `cram_decode_slice()` function called while readin

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2026-31966]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. As one method of removing redundant data, CRAM uses refer

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2026-31965]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. In the `cram_decode_slice()` function called while readin

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2026-31964]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. Whi

Medium(6.9)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2026-31963]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. As one method of removing redundant data, CRAM uses refer

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2026-31962]

Published:

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. While most alignment records store DNA sequence and quali

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    nvd · htslib · debian · 13

[CVE-2020-36403]

Published:

htslib: CVE-2020-36403

High(8.8)Невідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.11-1

    dsa · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.11-1

    dsa · htslib · debian · 13

[CVE-2018-14329]

Published:

htslib: CVE-2018-14329

LowНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Уражена

    dsa · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Уражена

    dsa · htslib · debian · 13

[CVE-2018-13844]

Published:

htslib: CVE-2018-13844

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · 13

[CVE-2018-13843]

Published:

htslib: CVE-2018-13843

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · 13

[CVE-2018-13845]

Published:

htslib: CVE-2018-13845

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.9-2

    dsa · htslib · debian · 13

[CVE-2017-1000206]

Published:

htslib: CVE-2017-1000206

MediumНевідомо

Зіставлення пакетів триває. Спостережено:

Подробиці (2)
  • 1.21+ds-1 · amd64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.4.1-1

    dsa · htslib · debian · 13

  • 1.21+ds-1 · arm64 · trixie

    Виправлена · Виправлена: 1.4.1-1

    dsa · htslib · debian · 13

Остання синхронізація:

[Каталог CVE]

Контрольні суми

Repository signatures authenticate metadata. Artifact hashing is recorded separately. Neither establishes package safety.

1.21+ds-1 / amd64Спостережено Sep 1, 2026sha256 d6e27b417eb4…5dc29cbeКонтрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha256): d6e27b417eb457c357071eb337684d3a4bf43dcb9c77d1cc0b8c2d945dc29cbe

Перевірити завантаження

printf '%s %s\n' 'd6e27b417eb457c357071eb337684d3a4bf43dcb9c77d1cc0b8c2d945dc29cbe' 'tabix_1.21+ds-1_amd64.deb' | sha256sum --check --strict -

Field source: Debian 13 (Trixie) main amd64

1.21+ds-1 / arm64Спостережено Sep 1, 2026sha256 a85b689066ec…e4df6f86Контрольна сума джерела

Metadata observed; artifact bytes were not independently fetched or hashed by this catalog import. The digest below is source-reported.

Контрольна сума джерела (sha256): a85b689066ecefb646558f43c33b28bb77d65afae2f614210fc101b0e4df6f86

Перевірити завантаження

printf '%s %s\n' 'a85b689066ecefb646558f43c33b28bb77d65afae2f614210fc101b0e4df6f86' 'tabix_1.21+ds-1_arm64.deb' | sha256sum --check --strict -

Field source: Debian 13 (Trixie) main arm64

Джерела

  • Authoritative source; repository metadata signature verified

    Доказ підпису

    trixie-main-amd64:3ab4e811cf4f3e5a335d382c58cc19d85f1abe7a4ef4689160ca1f637fa0e9b3

    Repository-signature verification record
    Signed-object SHA-256
    98b25b5cd185c59d34aa6e4c3e9b5b8f01bbe9d104fe2dcfbcd30dc0a14a59ed
    Signer fingerprint
    4CB50190207B4758A3F73A796ED0E7B82643E131
    Keyring revision
    debian-archive-keyring.gpg
    SHA-256 506b815cbb32d9b6066b4a2aa524071e071761e7e7f68c3ac74f3061ba852017
    Tool and policy
    gpgv (GnuPG) 2.4.9
    openfactory-software-catalog-signature-v1
    Verification time
    Sep 1, 2026
    Repository metadata hash linkage
    Path
    main/binary-amd64/Packages.xz
    Expected SHA-256
    3ab4e811cf4f3e5a335d382c58cc19d85f1abe7a4ef4689160ca1f637fa0e9b3
    Observed SHA-256
    3ab4e811cf4f3e5a335d382c58cc19d85f1abe7a4ef4689160ca1f637fa0e9b3
    Result
    match verified
  • Authoritative source; repository metadata signature verified

    Доказ підпису

    trixie-main-arm64:753da751bbc7a679f48bd1b623ffd4479cb6861c426118284c76eb82909e4908

    Repository-signature verification record
    Signed-object SHA-256
    98b25b5cd185c59d34aa6e4c3e9b5b8f01bbe9d104fe2dcfbcd30dc0a14a59ed
    Signer fingerprint
    4CB50190207B4758A3F73A796ED0E7B82643E131
    Keyring revision
    debian-archive-keyring.gpg
    SHA-256 506b815cbb32d9b6066b4a2aa524071e071761e7e7f68c3ac74f3061ba852017
    Tool and policy
    gpgv (GnuPG) 2.4.9
    openfactory-software-catalog-signature-v1
    Verification time
    Sep 1, 2026
    Repository metadata hash linkage
    Path
    main/binary-arm64/Packages.xz
    Expected SHA-256
    753da751bbc7a679f48bd1b623ffd4479cb6861c426118284c76eb82909e4908
    Observed SHA-256
    753da751bbc7a679f48bd1b623ffd4479cb6861c426118284c76eb82909e4908
    Result
    match verified